Tiene como objetivos el de agrupar a las personas interesadas en el campo de la endocrinología pediátrica y fomentar el desarrollo de la subespecialidad en sus aspectos asistenciales, de investigación y de enseñanza.
La SMEP está conciente de la responsabilidad social que implica el manejo de enfermedades que se gestan en la etapa pediátrica y forman parte de las principales causas de morbimortalidad en la población adulta en general, por lo que incluye actividades dirigidas no sólo a la población médica de la subespecialidad sino a todo profesional de la salud que se ve implicado en la atención del niño.

Fundada en 1999, la SMEP es actualmente una sólida asociación que agrupa a más del 90% de los endocrinólogos pediatras del país que laboran en medio particular y en los principales grupos hospitalarios sedes de cursos universitarios, con trabajo conjunto para asegurar el intercambio académico y la continuidad de la excelencia.